Курусь Нина Николаевна
| Дата рождения: | 24.07.1991 |
| Вуз (дата окончания): | Новосибирский государственный технический университет (НГТУ) (2015) |
| 2015 | |
| Форма обучения: | очная |
| 03.06.01 - "Физика и астрономия" | |
| Специальность: | 01.04.10 - "Физика полупроводников" |
| Тема диссертации: | Исследование взаимодействий биополимеров с полупроводниковой поверхностью при помощи механических методов |
| Научный руководитель: |
д.х.н., в.н.с. Дульцев Фёдор Николаевич |
| Лаборатория: | Лаб. №26 |
| E-mail: |
Публикации:
Статьи в рецензируемых научных журналах:
| Название | Первая страница |
|---|---|
| N. N. Kurus and F. N. Dultsev, MEASUREMENT OF THE UNWINDING FORCE OF A DNA DOUBLE HELIX/ Journal of Structural Chemistry |  |
| Dultsev F. N., Kurus N. N. Temperature dependence of unwinding forces between complementary oligonucleotides //Journal of Microbiological Methods. – 2017. |  |
| Kurus N. N., Dultsev F. N. Determination of the Thermodynamic Parameters of DNA Double Helix Unwinding with the Help of Mechanical Methods //ACS Omega. – 2018. – Т. 3. – №. 3. – С. 2793-2797. | |
| N. N. Kurus, F. N. Dultsev, G.Yu. Shevelev, A.A. Lomzov, D.V. Pyshnyi Effect of the relief on the measurement of bond rupture force with the help of AFM: the dynamics of interaction and optimization of the procedure, Analytical Methods, 2018, Accepted Manuscript, DOI: 10.1039/C8AY00821C |
Труды конференций:
| Название | Обложка | Первая страница |
|---|---|---|
| Дульцев Ф.Н., Курусь Н.Н., Шевелев Г.Ю., Ломзов А.А, Пышный Д.В., Измерение сил молекулярных взаимодействий для биологических и медицинских исследований, Всероссийская конференция с международным участием Биотехнология - медицине будущего, 24-26 июля 2017 |  |
 |
| Дульцев Ф.Н., Курусь Н.Н., Шевелев Г.Ю., Ломзов А.А., Пышный Д.В. |  |
 |
| Исследование кинетики гибридизации олигонуклеотидов ДНК методом VFDM/ Е.С. Дюдеева, Н.Н. Курусь, Ф.Н. Дульцев, А.А. Ломзов, Г. Ю. Шевелёв, Д.В. Пышный / VIII Международная школа молодых учёных по молекулярной генетике на тему: «Генетическая организация и молекулярные механизмы функционирования живых систем»/ ФГУБН Институт молекулярной генетики РАН- Москва, Звенигород, 2018 (19-23 ноября 2018г). | ||
| Использование кварцевого резонатора для определения термодинамических параметров механической денатурации двойной спирали ДНК / Д.В. Некрасов, Н.Н. Курусь, Ф.Н. Дульцев, А.А. Ломзов, Г. Ю. Шевелёв, Д.В. Пышный / VIII Международная школа молодых учёных по молекулярной генетике на тему: «Генетическая организация и молекулярные механизмы функционирования живых систем»/ ФГУБН Институт молекулярной генетики РАН- Москва, Звенигород, 2018 (19-23 ноября 2018г). |
Личное участие в конференциях:
| Название | Обложка тезисов | Обложка программы | Время выступления | Первая страница |
|---|---|---|---|---|
| Курусь Н.Н., Дульцев Ф.Н., Шевелев Г.Ю., Ломзов А.А., Пышный Д.В., Измерение силы разрыва молекулы ДНК методом атомно-силовой спектроскопии, Международная конференция «Химическая биология», Новосибирск, 24-28 июля 2016 г., стендовый доклад |  |
 |
 |
 |
| Nina N. Kurus, Georgiy Yu. Shevelev, Investigation of the energy profile of helix unwinding in DNA by means of atomic force spectroscopy, IX International Voevodsky Conference Physics and Chemistry of Elementary Chemical Processes, Novosibirsk, Russia, June 25-30, 2017, стендовый доклад | ||||
| Kurus N.N., Dultsev F.N., Shevelev G.Y., Lomzov A.A., Pyshnyi D.V., DETERMINATION OF DNA MELTING TEMPERATURE WITH THE HELP OF QCM, XXI International Conference on Chemical Thermodynamics in Russia, Novosibirsk, Russia, 26-30 June 2017, стендовый доклад |  |
 |
 |
 |
| Н.Н. Курусь, Ф.Н. Дульцев, Г.Ю. Шевелев, А.А. Ломзов, Д.В. Пышный, Исследование процесса денатурации ДНК-комплексов методом атомно-силовой спектроскопии, 2-й Международный форум "Техноюнити - Электронно-лучевые технологии для микроэлектроники ", Москва, Зеленоград, 9-12 октября 2017г, стендовый доклад |  |
 |
 |
 |
| Н.Н. Курусь, Ф.Н. Дульцев, А.А. Ломзов, Г. Ю. Шевелёв, Е.С. Дюдеева, Д.В. Пышный, Исследование энергетического профиля денатурации ДНК/ДНК- комплексов методом атомно-силовой спектроскопии, V Международная конференция молодых ученых: биотехнологов, молекулярных биологов и вирусологов , АНО «Инновационный центр Кольцово». — Новосибирск , 22-25 октября 2018г, устный доклад |
Личные достижения (дипломы, гранты, награды, сертификаты, именные стипендии):
- Победитель конкурса стипендий ИФП СО РАН в 2017г, присуждена стипендия имени К.К. Свиташёва
- Диплом за III место в секции "Молекулярная биология" V Международной научной конференции молодых учёных: биотехнологов, вирусологов, молекулярных биологов, прошедшей в рамках площадки открытых коммуникаций OpenBio-2018
Участие в грантах:
- Госконтракт №14.607.21.0125 «Разработка прототипа прибора для высокоспецифичной детекции биомаркеров на кварцевом резонаторе», научный руководитель – д.х.н. Ф.Н. Дульцев.
- РФФИ 18-34-00320 Исследование энергетического профиля денатурации ДНК методами силовой спектроскопии
Отчёты о выполнении НИР:
1-й семестр:
Методом АСМ в сканирующем режиме исследована поверхность подложек, используемых в экспериментах.В качестве объекта исследования выбраны два комплементарных олигонуклеотида длиной в 20 пар-оснований. Проведено выделение олигонуклеотидов после синтеза.
Отработана методика иммобилизации исследуемых молекул на поверхности подложки и зонда АСМ.
Освоена методика АСМ в режиме измерения силы связи.
Подготовлены материалы обзора литературы (1 глава диссертации). Подготовлены материалы обзорной статьи « Измерение силы раcкручивания двойной спирали ДНК».
2-й семестр:
Выполнен синтез модельных олигонуклеотидов для реализации двух режимов разрыва молекулы ДНК: сдвигового и с последовательным разрывом связи между нуклеотидами, а также двух частично комплементарных олигонуклеотидов (1 мисматч). Олигонуклеотиды были выделены в индивидуальном виде методом ОФХ, и охарактеризованы методами УФ-спектроскопии и масс-спектрометрии. Гомогенность выделенных олигонуклеотидов подтверждена методом гель-электрофореза в денатурирующих условиях (20% ПААГ, 8М мочевина).Отработаны протоколы иммобилизации олигонуклеотидов на поверхность золота и кремния, а также на поверхность зонда АСМ.
Проведены эксперименты по измерению сил разрыва дуплекса полностью комплементарных олигонуклеотидов в сдвиговом режиме.
3-й семестр:
Проведены эксперименты, подтверждающие формирование комплекса (двойной спирали) синтезированных олигонуклеотидов ДНК в буфере PBS (рН=7,5), а также успешное протекание иммобилизации по разработанному ранее протоколу. Проведено измерение сил разрыва дуплексов ДНК в сдвиговом режиме. Установлено, что неоднородность рельефа поверхности подложки способствует множественным связываниям между цепочками. Проведены эксперименты с частично некомплементарными последовательностями. Установлено, что наличие мисматчей в нуклеотидной последовательности приводит к уменьшению прочности двойной спирали ДНК.4-й семестр:
За отчетный период освоена методика сканирования явлений отрыва (REVS) при помощи кварцевых микровесов (QCM). Данным методом была измерена температурная зависимость силы разрыва дуплексов модельных олигонуклеотидов ДНК.5-й семестр:
Методом атомно-силовой спектроскопии измерена температурная зависимость силы разрыва модельного ДНК-комплекса в сдвиговом режиме. Измерена прочность ДНК-комплекса при разрыве в режиме с последовательным разделением нуклеотидов. Произведен расчет кинетических параметров реакции денатурации.6-й семестр:
Приведено исследование энергетического профиля реакции денатурации модельных ДНК-комплексов методом АСС. Выполнены синтез, выделение и характеризация модельных олигонуклеотидов ДНК с АТ- и GC-богатыми концами. Методом АСС измерена прочность ДНК-комплекса с АТ- и GC-богатыми концами, не содержащего нуклеотидных несоответствий.
Аннотация выпускной квалификационной работы: 