
Курусь Нина Николаевна
Дата рождения: | 24.07.1991 |
Вуз (дата окончания): | Новосибирский государственный технический университет (НГТУ) (2015) |
2015 | |
Форма обучения: | очная |
03.06.01 - "Физика и астрономия" | |
Специальность: | 01.04.10 - "Физика полупроводников" |
Тема диссертации: | Исследование взаимодействий биополимеров с полупроводниковой поверхностью при помощи механических методов |
Научный руководитель: |
д.х.н., в.н.с. Дульцев Фёдор Николаевич |
Лаборатория: | Лаб. №26 |
E-mail: |
Публикации:
Статьи в рецензируемых научных журналах:
Труды конференций:
Личное участие в конференциях:
Личные достижения (дипломы, гранты, награды, сертификаты, именные стипендии):
- Победитель конкурса стипендий ИФП СО РАН в 2017г, присуждена стипендия имени К.К. Свиташёва
- Диплом за III место в секции "Молекулярная биология" V Международной научной конференции молодых учёных: биотехнологов, вирусологов, молекулярных биологов, прошедшей в рамках площадки открытых коммуникаций OpenBio-2018
Участие в грантах:
- Госконтракт №14.607.21.0125 «Разработка прототипа прибора для высокоспецифичной детекции биомаркеров на кварцевом резонаторе», научный руководитель – д.х.н. Ф.Н. Дульцев.
- РФФИ 18-34-00320 Исследование энергетического профиля денатурации ДНК методами силовой спектроскопии
Отчёты о выполнении НИР:
1-й семестр:
Методом АСМ в сканирующем режиме исследована поверхность подложек, используемых в экспериментах.В качестве объекта исследования выбраны два комплементарных олигонуклеотида длиной в 20 пар-оснований. Проведено выделение олигонуклеотидов после синтеза.
Отработана методика иммобилизации исследуемых молекул на поверхности подложки и зонда АСМ.
Освоена методика АСМ в режиме измерения силы связи.
Подготовлены материалы обзора литературы (1 глава диссертации). Подготовлены материалы обзорной статьи « Измерение силы раcкручивания двойной спирали ДНК».
2-й семестр:
Выполнен синтез модельных олигонуклеотидов для реализации двух режимов разрыва молекулы ДНК: сдвигового и с последовательным разрывом связи между нуклеотидами, а также двух частично комплементарных олигонуклеотидов (1 мисматч). Олигонуклеотиды были выделены в индивидуальном виде методом ОФХ, и охарактеризованы методами УФ-спектроскопии и масс-спектрометрии. Гомогенность выделенных олигонуклеотидов подтверждена методом гель-электрофореза в денатурирующих условиях (20% ПААГ, 8М мочевина).Отработаны протоколы иммобилизации олигонуклеотидов на поверхность золота и кремния, а также на поверхность зонда АСМ.
Проведены эксперименты по измерению сил разрыва дуплекса полностью комплементарных олигонуклеотидов в сдвиговом режиме.
3-й семестр:
Проведены эксперименты, подтверждающие формирование комплекса (двойной спирали) синтезированных олигонуклеотидов ДНК в буфере PBS (рН=7,5), а также успешное протекание иммобилизации по разработанному ранее протоколу. Проведено измерение сил разрыва дуплексов ДНК в сдвиговом режиме. Установлено, что неоднородность рельефа поверхности подложки способствует множественным связываниям между цепочками. Проведены эксперименты с частично некомплементарными последовательностями. Установлено, что наличие мисматчей в нуклеотидной последовательности приводит к уменьшению прочности двойной спирали ДНК.4-й семестр:
За отчетный период освоена методика сканирования явлений отрыва (REVS) при помощи кварцевых микровесов (QCM). Данным методом была измерена температурная зависимость силы разрыва дуплексов модельных олигонуклеотидов ДНК.5-й семестр:
Методом атомно-силовой спектроскопии измерена температурная зависимость силы разрыва модельного ДНК-комплекса в сдвиговом режиме. Измерена прочность ДНК-комплекса при разрыве в режиме с последовательным разделением нуклеотидов. Произведен расчет кинетических параметров реакции денатурации.6-й семестр:
Приведено исследование энергетического профиля реакции денатурации модельных ДНК-комплексов методом АСС. Выполнены синтез, выделение и характеризация модельных олигонуклеотидов ДНК с АТ- и GC-богатыми концами. Методом АСС измерена прочность ДНК-комплекса с АТ- и GC-богатыми концами, не содержащего нуклеотидных несоответствий.